Bioinformatics

新型インフルエンザも下火になったとはいえ、まだ感染者が増えている状況です。 そうはいっても、季節性インフルエンザと比べて感染拡大はしていませんね。 過剰反応したマスコミは反省をしたのか、報道姿勢を変えているようですが、 まだまだ感染者を悪...

普段から利用しているCentOS 5.2で、.NETというかC#を利用したくて 先月リリースされた最新版のMonoである「2.2」を入れてみました。 サーバサイドプログラムはPerlを使っていますが、 型の定義やオブジェクト指向の利用が不...

9月始めから使っている「VMware ESXi」ですが、（9/26のブログ参照） VMware Infrastructure Client（VIC）を起動すると、 『あと10日で60日間の試用期間が終了するよ～』という警告が出ました。 焦...

昨日に続き、今日は新しいPCへのOSインストールの顛末です。 9/14のブログに書いたように、自作PCはRAID0ディスク（HDD 2台）構成です。 最初はOS用にSSDも考えたのですが、予算の都合とケースの内蔵スペースが狭いので止めまし...

少し前からになりますが、仮想サーバー環境である「VMware ESXi Server」を利用しています。 Webアプリケーションなどを開発していると、どうしてもテスト環境が必要になります。 今までは空いているPCにLinuxをインストール...

自宅で使用しているIntel iMacは、当初はMac OS X 10.4を利用していましたが、 仕事でも利用するようになるといろいろ不便も生じてきたので、 おもいきってWindows XPに切り替えました。 Boot Campを利用して...

私は前職で、バイオインフォマティクス研究者として、サーバー管理もしていました。 その当時、sshやpostgresなど一般的に外部に公開されているポートに対して、 時々ポートスキャンや軽いアタックを受けることは経験していました。 そのとき...

ある医薬品の有効性をみるときに、 薬物の血中濃度を測定することがよくあります。 これには、薬物の血中濃度を扱う薬物動態学（Pharmacokinetics:PK）を用います。 また、薬物の効果は薬物動力学（Pharamacodynamic...

今週に入って3日連続で、Rを使い倒しています。 PerlからRを使うのに、Perlモジュール「Statistics::R」をインストールしたものの エラーが出て動作しなかったので、以下のサイトを参考にバッチから実行しました。 RjpWi...

今日もほとんど一日中Rでした。 Perlスクリプト中でRを使っていますが、 思うように動作しない場合があったりで、試行錯誤中です。 Perlスクリプトの問題か、Rの使い方の問題か、 原因を分析して切り分けないといけませんね。 独立2...