Bioinformatics

現在取り組んでいる仕事の1つに医療分野の統計解析があります。 近年の医療・バイオ研究の世界は、大量のデータをコンピューターを使って解析する というバイオインフォマティクス（生命情報工学）が必須となってきています。 私はもともとバイオイン...

全角アルファベットを半角に変換するため、Encode.pm（昔のjcode.plやJcode.pm）を調べましたが、これ自体には全角→半角変換する機能は無いようだったので、Unicode::Japaneseを利用しました。 Unicode...

社内ITシステム管理者の１人として、サーバー監視ソフトの導入を検討しています。 Windows・Linux混在なのですが、とりあえずLinuxから。 ネットやSoftwareDesign誌の記事で、「MRTG」や「RRDtool」が良いら...

DBをつかったサーバーアプリを開発するときは、Apache+Perl+PostgreSQLでサーバーを構築しています。 最近CentOS5デビューしたので勝手がわからない面があるのですが、CGI（Perl）からPostgreSQLにアクセ...

遺伝統計学において検出力（Power）は非常に重要な要素です。 SNPをもちいたケース・コントロール研究において、検出力がある程度の大きさ（一般的に80%以上）がないと、その研究の信頼性が疑われます。 検出力は、ケース数・コントロール数...

Windows端末に続きLinuxも変わりました。こちらではCentOS5を使っています。 このCentOSですがRedHat系ということで慣れてはいる（今まではRedHat系のTurbo Linux遣い）ものの敬遠してきましたが、どうや...

１０月から新しい職場に移りました。 そこでの端末がWindows Vista Businessだったため、ついにVistaデビューとなりました。加えてOfficeも2003から操作性が大きく変わった2007になりました。 新しい環境は以前と...

AppleのX Serveに接続しているRAIDには、管理ソフトとして「RAID Admin」がついています。 このソフトでRAIDを管理しようとするとパスワードを求められますが、 何も設定していませんでした。 グーグル先生に聞いたとこ...

Mac OS X用のバックアップソフトを探してみたところ、 フリーで差分バックアップにも対応したソフトを見つけました。 その名もiBackup。 なかなか良さそうです。

昨日に引き続いて、Apacheのログファイル解析で、 日本語文字コードがShift_JISだったりUTF-8だったりするため Perlの文字コード変換モジュールEncode.pmを用いて変換しました。 use Encode; use En...