SNPによるGWAS解析を行うソフト「QuickGWAS Academic」をリリースしました。
何度もブログに書いてきましたが、GWAS解析を行うフリーのソフトはいくつか出ていますが、そのほとんど全てがコマンドラインによる操作で、実験研究者にとって使いやすいとは決して言えないソフトたちでした。
ただ、そのなかでもPLINKというSNP解析ソフトにはWindows版が存在するため、コマンドラインではなくマウス操作によるGUIインターフェースで直感的に操作ができるソフトを開発しました。
機能としては、case/control関連解析とQ-Qプロットおよびマンハッタンプロットの作成ができるようにして、p-value<1.0e-04のSNPもExcelで読み込めるタブ区切りテキストで出力するようにしました。
有償版のほうでは複雑なパラメーター設定や遺伝統計解析、QTL解析にも対応予定ですが、ひとまずは皆さんにGWASを試していただくために、無償版を公開しました。
バグ報告や使用感など、フィードバックをいただけましたら幸いです。
その際は、会社HPのお問い合わせからお願いします。
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