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秋ですね

秋は「芸術」ということで、個展やアートイベントに行ったり、レンタルDVDを借りてきて映画を観たりしています。 気候もすごしやすくて出歩く機会が自然と増えてしまいます。 さきほど、仕事に必要なPCとしてHP社のタッチパネル対応デスクトップを...
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京都出張から帰ってきました

1泊2日の京都出張から帰ってきました。 京都滞在で思ったことを箇条書きにしていきます。 ・修学旅行生が多かった ・外国人観光客、特に中国系のかたが多かった ・市内でも紅葉が始まりつつあったが、見る余裕が無かった(T_T) ・タクシーは安...
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雨ですね

先週の秋晴れとは打って変わって、今週は雨が続くようですね。 個人的に雨は好きです。 小学生の頃、教室の窓から見た雨の降るグラウンドが印象的で、今でもときどき思い出します。 他にも、ドライブ中に降ってきた土砂降りの雨で前が見えず、路肩に停...
Bioinformatics

Perl勉強中~続報~

10/18に書いた、dbSNPのXMLファイルを扱うBioPerlモジュールBio::ClusterIO::dbsnpですが、使用例のコードを走らせても、上手く情報が抽出できないトラブルに遭遇しています。 subsnpなど、XMLの構造は...
Bioinformatics

Perl勉強中~Bioinformatics(続)~

PerlでのdbSNPのXMLファイルの取り扱いについて昨日の続き・・・ 2006年ごろ(dbSNP Build127当時)に正規表現で抽出するPerlスクリプトは作っていましたが、今回の最新版(Build130)では書式が若干変更されて...
Bioinformatics

Perl勉強中~Bioinformatics~

昨日に続き、Perlについて。 ゲノムDNAの多型のうち、一塩基の多型をSNP(Single Nucleotide Polymorphism)といいます。 SNPについての詳細はネットで検索していただくとして、SNP情報は、米国NCBIの...
Bioinformatics

Perl勉強中~Webフレームワーク~

最近、時間をつくっては「Perl(特にモダンPerl)」を勉強しています。 「モダンPerl」というのは、オブジェクト指向やここ5年ほどの技術や手法を取り入れた、Perlの書き方のことです。 Perlのオブジェクト指向自体はだいぶ前から...
Business

進行中の案件

今日の午後は、進行中の案件についてディスカッションしました。 関西でのミーティング内容を共有すると同時に、 新たな課題を解決するためのディスカッションだったのですが、 期待以上に課題とその対処法が明確化してきました。 やはり仕事はコミュ...
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関西出張から帰ってきました

数日間におよぶ関西出張から帰ってきました。 出身大学院のホームカミングデイ(OB・OG・現役生の飲み会)に参加し 旧交を温めてきたのですが、研究の情報を集められる貴重な機会でもあります。 懐かしい人たちとの会話で、少々お酒が進みすぎてしま...
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終戦記念日

昨日まで5日連続したバイオインフォマティクスの話題は休憩して、 「今日=終戦記念日」という日に思いを馳せたいとおもいます。 自分は1976年生まれで、両親も戦後生まれなので、直接は第二次世界大戦を知りません。 ただ、幸いなことに、祖父母が...
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