Bioinformatics PLINKによるSNP解析とQTL解析
PLINKの使い方やQTL解析の方法もよくご質問いただきます。
PLINKはオープンソースのゲノム解析ソフトで、
SNPのゲノムワイド関連解析（Genome Wide Association Study:GWAS）によく用いられます。
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Bioinformatics Bioinformatics Primer3によるプライマー設計
【更新 2018/05/10】リンクを貼り直しました。
Primer3によるプライマー設計についての質問をよくいただきますので、
会社のブログの方にPrimer3の使い方をまとめました。
関連記事をリンクしますので、参考にしていただけた...
Weblog 紀元前・紀元後
紀元前はBC、つまりBefore Christといいますが、
紀元後（というかわかりませんが）、つまり西暦はADですね。
このADの意味がよくわかっていませんでしたが、ある日本のブログ記事で
英語のブログが引用されていたため、ADがAnn...
Bioinformatics Windowsにおけるもう一つのPerl環境「Strawberry Perl」
先日のブログでも紹介しましたが、Windows上で動作するPerl環境である「Strawberry Perl」を利用しています。
WindowsのPerlで最も有名なものに「Active Perl」がありますが、モジュールの管理にCPAN...
Business 会社ブログも始めました
こちらで書いているブログは、アメリエフ社長である「山口」個人のブログですが、
社員が書き込みをする「会社のブログ」を作成しました。
もちろん会社のドメイン付き!です。
社員の日々のことも書いていく予定ですが、バイオインフォマティクスのノ...
Bioinformatics Mooseデビューしました
Perlのオブジェクト指向の１実装である「Moose」にトライしました。
バージョンは最新の1.02です。
なお、Linux版（CentOS 5.4 64bit上）でもStrawberry Perl版（WindowsのCygwin上）でも利...
Weblog 政府のしごと
私だけではないとおもいますが、現政権をみていると非常にもどかしい。
政府の仕事は、外向きの仕事である外政（外交も含めた国家安全保障）と、国内の行政である内政の2つに大きく分けられるとおもいます。
日本の国家元首にはその両方が求められる...
Business 新卒の就活は中小企業がオススメ
本日（2010/05/03）の日経新聞12面に、「大学新卒の就活で中堅・中小企業に応募が殺到している」という趣旨の記事が掲載されていました。とても喜ばしいことだとおもいます。
大企業で働くことには大きな長所もありますが、短所も数多くありま...
Bioinformatics Rのパッケージ群「Genetics」をインストール
統計解析ソフト「R」を日常的につかっています。
普段はWindowsのデスクトップ上での利用ですが、バッチ処理を回す場合も多いため、Linuxにインストールすることにしました。
### サーバー構成 ###
サーバー：自作
CPU：Cor...
Weblog 火山の噴火の影響
アイスランドの火山噴火の影響が大きく広がりましたが、空港についてはようやく沈静化に向かっていますね。
ドイツにいる知人は帰国できないとメールがありましたし、アフリカへ赴任予定の知人は、ロンドン経由で行く予定を急遽ドバイ経由に変える予定だそう...